Поиск по блогу

среда, 19 февраля 2014 г.

Короткий пост об обновлении Anaconda "Conda update conda"

При обновлении Anaconda возникла проблема (формирования ... стека?) В процессе изысканий я решил сделать лог (см.ниже). А вот прямая ссылка в Google Drive

Суть проблемы.

При попытке построить диаграмму (vincent) в посте Introduction to Pandas and Vincent возникла "непонятная" ошибка. В предыдущих постах vincent грузился, а тут вдруг перестал. Гугл подсказал, что надо бы обновить Анаконду...
Однако обновление выдало еще одну ошибку (см. фрейм выше): An unexpected error has occurred, please consider sending the | 55% following traceback to the conda GitHub issue tracker at:
https://github.com/conda/conda/issues
Include the output of the command 'conda info' in your report.
Ошибка возникла, когда я попытался обновить всю сборку conda Update Anaconda to latest version,
как видно из лога (фрейм выше) все обновления сначала скачались в локальную временную папку, а потом при обновлении возникла ошибка.
In []:
$ conda update conda

# Now you are ready to update Anaconda

$ conda update anaconda
Решил попробовать обновлять модули не все вместе, а по одному... Распечатал список всех модулей и последовательно стал обновлять... (подробности ниже)
Оказалось, что при обновлении два модуля требовали обновления новой версии numpy на старую:
In []:
При попытке установить numexpr выскочила ошибка, которую я скопировал ниже, из записей можно понять, что подгружается numpy
версии 1.7.. а самая последняя 1.8
+++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
при выполнении команд по одной, выяснилось, что numexpr предлагает установить версию numpy-1.7.  
а на компьютере уже была установлена более новая версия numpy-1.8.0 
я просто не стал обновлять numexpr (уповая на обратную совместимость)
////
Я продолжил обновлять модули, когда дошел до pytables, она потребовала numexpr, а он то, как  мы установили и просил для обновления старый 
1.7.. модуль numpy... а для pandas мы уже загрузили 1.8...
pytables тоже не стал обновлять
++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ 
Повторяю, это открытие я сделал в процессе последовательного выполнения вот таких команд установки модулей (обратил внимание на номера версий):
In []:
c:\Users\kiss\Anaconda>conda install pandas
Теперь все обновлено и все работает (даже vincent), вот список моих модулей:
In [2]:
!conda list
# packages in environment at C:\Users\kiss\Anaconda:
#
_license                  1.1                      py27_0  
anaconda                  1.9.0                np18py27_0  
apptools                  4.2.1                    py27_0  
argcomplete               0.6.7                    py27_0  
astropy                   0.3.0                np18py27_1  
atom                      0.3.6                    py27_0  
backports.ssl-match-hostname 3.4.0.2                   <pip>
beautiful-soup            4.3.1                    py27_0  
beautifulsoup4            4.3.1                     <pip>
binstar                   0.4.4                    py27_1  
biopython                 1.63                 np18py27_0  
bitarray                  0.8.1                    py27_1  
blaze                     0.4.1                np18py27_0  
blz                       0.6.1                np18py27_0  
bokeh                     0.4                  np18py27_0  
boto                      2.24.0                   py27_0  
casuarius                 1.1                      py27_0  
cdecimal                  2.3                      py27_1  
chaco                     4.4.1                np18py27_0  
colorama                  0.2.7                    py27_0  
conda                     3.0.4                    py27_0  
configobj                 4.7.2                    py27_0  
cssselect                 0.9.1                     <pip>
cubes                     0.10.2                   py27_4  
cython                    0.20                     py27_0  
datashape                 0.1.0                np18py27_0  
dateutil                  2.1                      py27_2  
distribute                0.6.45                   py27_0  
django                    1.6                       <pip>
docutils                  0.11                     py27_0  
dynd-python               0.6.0                np18py27_0  
enable                    4.3.0                np18py27_1  
enaml                     0.9.0                    py27_0  
envisage                  4.4.0                    py27_1  
flask                     0.10.1                   py27_1  
furl                      0.3.6                     <pip>
future                    0.11.2                   py27_0  
gevent                    1.0                      py27_0  
gevent-websocket          0.9.2                    py27_0  
gevent-zeromq             0.2.2                     <pip>
gevent_zeromq             0.2.5                    py27_3  
grab                      0.4.13                    <pip>
greenlet                  0.4.2                    py27_0  
grin                      1.2.1                    py27_2  
h5py                      2.2.1                np18py27_0  
imaging                   1.1.7                    py27_2  
ipython                   1.1.0                    py27_1  
ipython-notebook          1.1.0                    py27_1  
ipython-qtconsole         1.1.0                    py27_1  
itsdangerous              0.23                     py27_0  
jinja2                    2.7.2                    py27_0  
keyring                   3.3                      py27_0  
kiwisolver                0.1.2                    py27_0  
launcher                  0.1.2                    py27_0  
libpython                 1.0                      py27_1  
llvmmath                  0.1.1                np16py27_2  
llvmpy                    0.12.2                   py27_0  
lxml                      3.2.3                    py27_0  
markupsafe                0.18                     py27_1  
matplotlib                1.3.1                np18py27_1  
mayavi                    4.3.1                np18py27_0  
mdp                       3.3                  np18py27_0  
menuinst                  1.0.3                    py27_0  
meta                      0.4.2.dev                py27_0  
mingw                     4.7                           1  
mock                      1.0.1                    py27_0  
networkx                  1.8.1                    py27_0  
nltk                      2.0.4                np18py27_0  
nose                      1.3.0                    py27_1  
numba                     0.12.0               np18py27_0  
numexpr                   2.3                       <pip>
numpy                     1.8.0                    py27_0  
openpyxl                  1.8.2                    py27_0  
orderedmultidict          0.7.1                     <pip>
pandas                    0.13.1               np18py27_0  
patsy                     0.2.1                np18py27_0  
pep8                      1.4.6                    py27_0  
pil                       1.1.7                    py27_0  
pip                       1.5.2                    py27_0  
ply                       3.4                      py27_0  
psutil                    1.1.2                    py27_0  
py                        1.4.20                   py27_0  
pycosat                   0.6.0                    py27_0  
pycparser                 2.10                     py27_0  
pycrypto                  2.6.1                    py27_1  
pycurl                    7.19.0.2                  <pip>
pyface                    4.4.0                    py27_0  
pyflakes                  0.7.3                    py27_0  
pygments                  1.6                      py27_0  
pykit                     0.1.0                np18py27_2  
pyopenssl                 0.13                      <pip>
pyparsing                 2.0.1                    py27_0  
pyquery                   1.2.7                     <pip>
pyreadline                2.0                      py27_0  
pysal                     1.6.0                np18py27_1  
pyside                    1.2.1                    py27_0  
pytest                    2.5.2                    py27_0  
python                    2.7.5                         2  
python-dateutil           1.5                       <pip>
pytz                      2013b                    py27_0  
pywin32                   218.4                    py27_0  
pyyaml                    3.10                     py27_1  
pyzmq                     2.2.0.1                  py27_1  
queuelib                  1.1.1                     <pip>
requests                  2.2.1                    py27_0  
rope                      0.9.4                    py27_0  
scikit-image              0.9.3                np18py27_1  
scikit-learn              0.14.1               np18py27_2  
scipy                     0.13.3               np18py27_0  
scrapy                    0.20.1                    <pip>
setuptools                2.2                      py27_0  
six                       1.5.2                    py27_0  
sphinx                    1.2.1                    py27_0  
spyder                    2.2.5                    py27_0  
spyder-app                2.2.5                    py27_1  
sqlalchemy                0.9.2                    py27_0  
ssl_match_hostname        3.4.0.2                  py27_0  
statsmodels               0.5.0                np18py27_1  
sympy                     0.7.4.1                  py27_0  
tornado                   3.2.0                    py27_0  
traits                    4.4.0                    py27_0  
traitsui                  4.4.0                    py27_0  
twisted                   13.2.0                    <pip>
ujson                     1.33                     py27_0  
vincent                   0.4.2                     <pip>
vitables                  2.1                       <pip>
vtk                       5.10.1                   py27_0  
w3lib                     1.5                       <pip>
werkzeug                  0.9.4                    py27_0  
wsgiref                   0.1.2                     <pip>
xlrd                      0.9.2                    py27_0  
xlwt                      0.7.5                    py27_0  
zope.interface            4.0.5                     <pip>
# packages in environment at C:\Users\kiss\Anaconda:
#
_license                  1.1                      py27_0  
anaconda                  1.9.0                np18py27_0  
apptools                  4.2.1                    py27_0  
argcomplete               0.6.7                    py27_0  
astropy                   0.3.0                np18py27_1  
atom                      0.3.6                    py27_0  
backports.ssl-match-hostname 3.4.0.2                   <pip>
beautiful-soup            4.3.1                    py27_0  
beautifulsoup4            4.3.1                     <pip>
binstar                   0.4.4                    py27_1  
biopython                 1.63                 np18py27_0  
bitarray                  0.8.1                    py27_1  
blaze                     0.4.1                np18py27_0  
blz                       0.6.1                np18py27_0  
bokeh                     0.4                  np18py27_0  
boto                      2.24.0                   py27_0  
casuarius                 1.1                      py27_0  
cdecimal                  2.3                      py27_1  
chaco                     4.4.1                np18py27_0  
colorama                  0.2.7                    py27_0  
conda                     3.0.4                    py27_0  
configobj                 4.7.2                    py27_0  
cssselect                 0.9.1                     <pip>
cubes                     0.10.2                   py27_4  
cython                    0.20                     py27_0  
datashape                 0.1.0                np18py27_0  
dateutil                  2.1                      py27_2  
distribute                0.6.45                   py27_0  
django                    1.6                       <pip>
docutils                  0.11                     py27_0  
dynd-python               0.6.0                np18py27_0  
enable                    4.3.0                np18py27_1  
enaml                     0.9.0                    py27_0  
envisage                  4.4.0                    py27_1  
flask                     0.10.1                   py27_1  
furl                      0.3.6                     <pip>
future                    0.11.2                   py27_0  
gevent                    1.0                      py27_0  
gevent-websocket          0.9.2                    py27_0  
gevent-zeromq             0.2.2                     <pip>
gevent_zeromq             0.2.5                    py27_3  
grab                      0.4.13                    <pip>
greenlet                  0.4.2                    py27_0  
grin                      1.2.1                    py27_2  
h5py                      2.2.1                np18py27_0  
imaging                   1.1.7                    py27_2  
ipython                   1.1.0                    py27_1  
ipython-notebook          1.1.0                    py27_1  
ipython-qtconsole         1.1.0                    py27_1  
itsdangerous              0.23                     py27_0  
jinja2                    2.7.2                    py27_0  
keyring                   3.3                      py27_0  
kiwisolver                0.1.2                    py27_0  
launcher                  0.1.2                    py27_0  
libpython                 1.0                      py27_1  
llvmmath                  0.1.1                np16py27_2  
llvmpy                    0.12.2                   py27_0  
lxml                      3.2.3                    py27_0  
markupsafe                0.18                     py27_1  
matplotlib                1.3.1                np18py27_1  
mayavi                    4.3.1                np18py27_0  
mdp                       3.3                  np18py27_0  
menuinst                  1.0.3                    py27_0  
meta                      0.4.2.dev                py27_0  
mingw                     4.7                           1  
mock                      1.0.1                    py27_0  
networkx                  1.8.1                    py27_0  
nltk                      2.0.4                np18py27_0  
nose                      1.3.0                    py27_1  
numba                     0.12.0               np18py27_0  
numexpr                   2.3                       <pip>
numpy                     1.8.0                    py27_0  
openpyxl                  1.8.2                    py27_0  
orderedmultidict          0.7.1                     <pip>
pandas                    0.13.1               np18py27_0  
patsy                     0.2.1                np18py27_0  
pep8                      1.4.6                    py27_0  
pil                       1.1.7                    py27_0  
pip                       1.5.2                    py27_0  
ply                       3.4                      py27_0  
psutil                    1.1.2                    py27_0  
py                        1.4.20                   py27_0  
pycosat                   0.6.0                    py27_0  
pycparser                 2.10                     py27_0  
pycrypto                  2.6.1                    py27_1  
pycurl                    7.19.0.2                  <pip>
pyface                    4.4.0                    py27_0  
pyflakes                  0.7.3                    py27_0  
pygments                  1.6                      py27_0  
pykit                     0.1.0                np18py27_2  
pyopenssl                 0.13                      <pip>
pyparsing                 2.0.1                    py27_0  
pyquery                   1.2.7                     <pip>
pyreadline                2.0                      py27_0  
pysal                     1.6.0                np18py27_1  
pyside                    1.2.1                    py27_0  
pytest                    2.5.2                    py27_0  
python                    2.7.5                         2  
python-dateutil           1.5                       <pip>
pytz                      2013b                    py27_0  
pywin32                   218.4                    py27_0  
pyyaml                    3.10                     py27_1  
pyzmq                     2.2.0.1                  py27_1  
queuelib                  1.1.1                     <pip>
requests                  2.2.1                    py27_0  
rope                      0.9.4                    py27_0  
scikit-image              0.9.3                np18py27_1  
scikit-learn              0.14.1               np18py27_2  
scipy                     0.13.3               np18py27_0  
scrapy                    0.20.1                    <pip>
setuptools                2.2                      py27_0  
six                       1.5.2                    py27_0  
sphinx                    1.2.1                    py27_0  
spyder                    2.2.5                    py27_0  
spyder-app                2.2.5                    py27_1  
sqlalchemy                0.9.2                    py27_0  
ssl_match_hostname        3.4.0.2                  py27_0  
statsmodels               0.5.0                np18py27_1  
sympy                     0.7.4.1                  py27_0  
tornado                   3.2.0                    py27_0  
traits                    4.4.0                    py27_0  
traitsui                  4.4.0                    py27_0  
twisted                   13.2.0                    <pip>
ujson                     1.33                     py27_0  
vincent                   0.4.2                     <pip>
vitables                  2.1                       <pip>
vtk                       5.10.1                   py27_0  
w3lib                     1.5                       <pip>
werkzeug                  0.9.4                    py27_0  
wsgiref                   0.1.2                     <pip>
xlrd                      0.9.2                    py27_0  
xlwt                      0.7.5                    py27_0  
zope.interface            4.0.5                     <pip>

И, в заключение, повторю здесь список опций команд conda
In [3]:
! conda help
usage: conda-script.py [-h] [-V] command ...

conda is a tool for managing environments and packages.

positional arguments:
  command
    info         Display information about current conda install.
    help         Displays a list of available conda commands and their help
                 strings.
    list         List linked packages in a conda environment.
    search       Search for packages and display their information. The input
                 is a regular expression. To perform a search with a search
                 string that starts with a -, separate the search from the
                 options with --, like 'conda search -- -h'.
    create       Create a new conda environment from a list of specified
                 packages.
    install      Install a list of packages into a specified conda
                 environment.
    update       Update conda packages.
    remove       Remove a list of packages from a specified conda environment.
    config       Modify configuration values in .condarc. This is modeled
                 after the git config command. Writes to the user .condarc
                 file (C:\Users\kiss\.condarc) by default.
    init         Initialize conda into a regular environment (when conda was
                 installed as a Python package, e.g. using pip).
    clean        Remove unused packages and caches
    package      Low-level conda package utility. (EXPERIMENTAL)
    bundle       Create or extract a "bundle package" (EXPERIMENTAL)

optional arguments:
  -h, --help     show this help message and exit
  -V, --version  show program's version number and exit

external commands:



Посты чуть ниже также могут вас заинтересовать

Комментариев нет:

Отправить комментарий